- Opettaja
Eija Siltari
Kategoria: Yliopistopedagogiikan opinnot
Turun yliopiston Moodle
Hakutulokset
A small course for one credit, about pedagogy for university teachers.
- Opettaja
Trang Nguyen
Kategoria: Yliopistopedagogiikka
- Opettaja
Tella Lantta
Kategoria: Hoitotieteen laitos
Tavoitteet
Kurssin suoritettuaan opiskelijalla on laaja ymmärrys nykypäivän bioetiikan teemoista; opiskelija ymmärtää erilaisten näkökulmien perustelut ja vasta-argumentit, osaa löytää eri argumenteista samankaltaisuuksia ja eroavaisuuksia, ymmärtää argumenttien vahvuudet ja rajoitteet sekä osaa soveltaa argumentointimenetelmiä omassa ajattelussaan.
Kurssin suoritettuaan opiskelijalla on laaja ymmärrys nykypäivän bioetiikan teemoista; opiskelija ymmärtää erilaisten näkökulmien perustelut ja vasta-argumentit, osaa löytää eri argumenteista samankaltaisuuksia ja eroavaisuuksia, ymmärtää argumenttien vahvuudet ja rajoitteet sekä osaa soveltaa argumentointimenetelmiä omassa ajattelussaan.
- Opettaja
Joona Räsänen
Kategoria: Filosofia
Tavoitteet
Opiskelija tiedostaa alaansa liittyvät eettiset kysymykset ja kykenee perustelemaan niitä koskevat mielipiteensä.
Opiskelija tiedostaa alaansa liittyvät eettiset kysymykset ja kykenee perustelemaan niitä koskevat mielipiteensä.
- Opettaja
Päivi Koskinen
Kategoria: Biologian laitos
Tavoitteet
Opiskelija hahmottaa biosfäärin muodostuksen evolutiivisena prosessina, jossa elottoman ja elollisen luonnon kehitys ovat jatkuvassa vuorovaikutuksessa. Hänellä on hyvä peruskäsitys maapallon biomeista, mittakaavan merkityksestä ja ympäristöolosuhteiden vaihteluista. Hän tuntee biogeografian keskeisimpiä teorioita ja käsitteistöä sekä ymmärtää niiden hyödyntämismahdollisuuksia yhteiskunnassa.
Opiskelija hahmottaa biosfäärin muodostuksen evolutiivisena prosessina, jossa elottoman ja elollisen luonnon kehitys ovat jatkuvassa vuorovaikutuksessa. Hänellä on hyvä peruskäsitys maapallon biomeista, mittakaavan merkityksestä ja ympäristöolosuhteiden vaihteluista. Hän tuntee biogeografian keskeisimpiä teorioita ja käsitteistöä sekä ymmärtää niiden hyödyntämismahdollisuuksia yhteiskunnassa.
- Opettaja
Risto Kalliola
Kategoria: Maantieteen ja geologian laitos
Objectives
Bioimage Informatics is a field of science that deals with the processing, analysis, visualization, handling and annotation of bioimages, using specialized software tools. An important aim in the field is to extract quantitative information from digital biomedical images. Starting from the fundamental concepts of digital images in biomedical sciences, students are introduced to various image processing and analysis techniques and tools. Along with lectures, demonstrations will be arranged to provide hands on training in image processing and in-depth and intuitive understanding of modern bioimage informatics approaches and applications. Further studies around the topic can be continued on course BioImage Informatics 2.
After the course, the student will be able to identify common phases in bioimage analysis, select proper methods and approaches for basic analysis tasks, explain the benefits of the use of bioimage informatics for quantification of biomedical images, and compare the differences of manual and computer based analysis of images.
Bioimage Informatics is a field of science that deals with the processing, analysis, visualization, handling and annotation of bioimages, using specialized software tools. An important aim in the field is to extract quantitative information from digital biomedical images. Starting from the fundamental concepts of digital images in biomedical sciences, students are introduced to various image processing and analysis techniques and tools. Along with lectures, demonstrations will be arranged to provide hands on training in image processing and in-depth and intuitive understanding of modern bioimage informatics approaches and applications. Further studies around the topic can be continued on course BioImage Informatics 2.
After the course, the student will be able to identify common phases in bioimage analysis, select proper methods and approaches for basic analysis tasks, explain the benefits of the use of bioimage informatics for quantification of biomedical images, and compare the differences of manual and computer based analysis of images.
- Opettaja
Pekka Ruusuvuori
Objectives
By the end of the study module students will be able to:
- understand the basic bioinformatics approaches for transcriptomics data preprocessing, quality control, differential expression analysis and gene function enrichment analysis
- Run a basic R data analysis workflow independently for transcriptomics sequencing data
- Use databases available on the internet that link protein sequence-level information to atom-detailed interaction data
- Produce protein sequence alignments, and explain how sequence differences can be reflected in protein structure and function, for example, how the differences affect the ability to bind drug molecules
-Independently produce research results, which are based on topics covered during the course
By the end of the study module students will be able to:
- understand the basic bioinformatics approaches for transcriptomics data preprocessing, quality control, differential expression analysis and gene function enrichment analysis
- Run a basic R data analysis workflow independently for transcriptomics sequencing data
- Use databases available on the internet that link protein sequence-level information to atom-detailed interaction data
- Produce protein sequence alignments, and explain how sequence differences can be reflected in protein structure and function, for example, how the differences affect the ability to bind drug molecules
-Independently produce research results, which are based on topics covered during the course
- Opettaja
Olli Pentikäinen
Tavoitteet
Kurssin suoritettuaan opiskelija osaa käsitellä sekvenssimuotoista molekyylidataa, muokata isoa taulukkomuotoista dataa sekä ymmärtää bioinformatiikan keskeiset käsitteet ja menetelmien perusteet. Kurssin jälkeen opiskelija osaa komentojen alkeet LINUX/UNIX -ympäristössä ja käyttää R-ohjelmistoa tehokkaasti ja monipuolisesti.
Kurssin suoritettuaan opiskelija osaa käsitellä sekvenssimuotoista molekyylidataa, muokata isoa taulukkomuotoista dataa sekä ymmärtää bioinformatiikan keskeiset käsitteet ja menetelmien perusteet. Kurssin jälkeen opiskelija osaa komentojen alkeet LINUX/UNIX -ympäristössä ja käyttää R-ohjelmistoa tehokkaasti ja monipuolisesti.
- Opettaja
Eero Vesterinen
Kategoria: Biologian laitos
- Opettaja
Jarmo Käpylä
Kategoria: Bioteknologian laitos
- Opettaja
Minna Vainio
Kategoria: Biologian laitos
Avoimen yliopiston opiskelijat ja biologian sivuaineeksi valinneet tutkinto-opiskelijat suorittavat harjoitukset verkko-opintoina.
Harjoitukset koostuvat ohjatuista maasto-, laboratorio- ja aineistonkäsittelyharjoituksista, joihin kuuluu työskentely tutkimuksen perusvälineistön, laitteiden ja malliorganismien kanssa sekä valikoitujen perusilmiöiden käytännön havainnointi, analysointi ja raportointi ekologian alalla.
- Opettaja
Tero Klemola
Kategoria: Biologia
Ekologian peruskurssin harjoitusten osio kuuluu biologian pakollisiin pääaineopintoihin ja biologia toisena opetettavana aineena -opintoihin. Näitä suorittaville opiskelijoille harjoitukset järjestetään kontaktiopetuksena yliopistolla.
Harjoitukset koostuvat ohjatuista maasto-, laboratorio- ja aineistonkäsittelyharjoituksista, joihin kuuluu työskentely tutkimuksen perusvälineistön, laitteiden ja malliorganismien kanssa sekä valikoitujen perusilmiöiden käytännön havainnointi, analysointi ja raportointi ekologian alalla.
- Opettaja
Tero Klemola
Kategoria: Biologian laitos
- Opettaja
Tapio Eeva
Kategoria: Biologian laitos
Tavoitteet
Opiskelija tietää, mitä genetiikka tieteenalana tutkii ja hänellä on aineopintoja varten tarvittava ymmärrys genetiikan keskeisimmistä peruskäsitteistä ja termeistä molekyyleistä laajempiin kokonaisuuksiin asti. Kurssin harjoitustyöosion suoritettuaan opiskelija tuntee genetiikan laboratoriotutkimuksen perustyöskentelytavat ja -menetelmät sekä tutkimustyön eri vaiheet. Opiskelija osaa tulkita harjoitustöiden tuloksia biologisen teoriatiedon avulla.
Opiskelija tietää, mitä genetiikka tieteenalana tutkii ja hänellä on aineopintoja varten tarvittava ymmärrys genetiikan keskeisimmistä peruskäsitteistä ja termeistä molekyyleistä laajempiin kokonaisuuksiin asti. Kurssin harjoitustyöosion suoritettuaan opiskelija tuntee genetiikan laboratoriotutkimuksen perustyöskentelytavat ja -menetelmät sekä tutkimustyön eri vaiheet. Opiskelija osaa tulkita harjoitustöiden tuloksia biologisen teoriatiedon avulla.
- Opettaja
Riitta Nissinen
Kategoria: Biologian laitos
- Opettaja
Eeva-Riikka Vehniäinen
Kategoria: Biologian laitos
- Opettaja
Kai Ruohomäki
Kategoria: Biologian laitos
- Opettaja
Minna Vainio
Kategoria: Biologian laitos
Kurssi toimii ajanmukaisena ja vahvana esimerkkinä tutkimukseen
perustuvasta opetuksesta esittelemällä ekologista, evoluutiobiologista,
geneettistä, fysiologista ja taksonomista tutkimusta ja tutkimusryhmiä.
Tutkijat ja projektit esittelevät tutkimusalojaan ja keskustelevat
opiskelijoiden kanssa biologian eri alojen perus- ja soveltavan
tutkimuksen kysymyksenasetteluista ja tuloksista seminaareissa, ja opiskelijat tutustuvat valitsemaansa aiheeseen valmistamalla siitä esittelyposterin. Kurssiin
on sisällytetty myös opintoneuvontaa LuK-opinnoista.
- Opettaja
Veijo Jormalainen
Kategoria: Biologian laitos
Evoluutiobiologia on biologian aineopintojen pakollinen kurssi.
Opintojakson suoritettuaan opiskelija ymmärtää evoluution roolin biologiaa yhdistävänä paradigmana ja osaa soveltaa evolutiivista ajattelutapaa biologian eri alueilla. Opiskelija pystyy selittämään, miten evoluutiovoimat vaikuttavat geneettiseen monimuotoisuuteen, muovaavat genotyyppejä ja fenotyyppejä sekä vaikuttavat lajeihin ja niiden välisiin vuorovaikutuksiin. Opiskelija osaa analysoida evoluutiovoimien merkitystä sopeutumisessa abioottiseen ja bioottiseen ympäristöön, populaatioiden erilaistumisessa, sekä uusien lajien synnyssä.
Opintojakson suoritettuaan opiskelija ymmärtää evoluution roolin biologiaa yhdistävänä paradigmana ja osaa soveltaa evolutiivista ajattelutapaa biologian eri alueilla. Opiskelija pystyy selittämään, miten evoluutiovoimat vaikuttavat geneettiseen monimuotoisuuteen, muovaavat genotyyppejä ja fenotyyppejä sekä vaikuttavat lajeihin ja niiden välisiin vuorovaikutuksiin. Opiskelija osaa analysoida evoluutiovoimien merkitystä sopeutumisessa abioottiseen ja bioottiseen ympäristöön, populaatioiden erilaistumisessa, sekä uusien lajien synnyssä.
- Opettaja
Päivi Onkamo
Kategoria: Biologian laitos
Kurssin keskeinen sisältö
Mitä on evoluutio ja miten populaatioissa esiintyvä muuntelu liittyy siihen? Miten luonnonvalinta, seksuaalivalinta ja muut evoluutiovoimat toimivat? Miten ne erikseen ja yhdessä synnyttävät ja muokkaavat populaatioiden sisäistä ja välistä vaihtelua molekyylitasolta ekosysteemitasolle? Miten perinnöllinen muuntelu ja evoluutiovoimat vaikuttavat populaatioden ekologisiin piirteisiin kuten parinvalintaan, lajien välisiin interaktioihin tai elinkierto-ominaisuuksiin.
Kurssin tavoitteet
Opiskelija ymmärtää muuntelun ja evoluution roolin biologiaa yhdistävänä paradigmana. Hän oppii soveltamaan evolutiivista ajattelutapa tutkittaessa erilaisia biologisia ilmiöitä kuten käyttäytymistä, elinkiertoja, populaatioiden uhanalaisuutta, lajien välisiä ekologisisia interaktioita, fysiologisissa ilmiöitä kuten sopeutumista happipitoisuuteen, sairauksien esiintymistä tai sukupuiden paljastamia menneisyyden tapahtumia.
- Opettaja
Päivi Onkamo
Kategoria: Biologian laitos
R is a freely available programming platform, rapidly becoming a modern standard. The objective of this course is to get familiar with working in the R environment and how you can code programs to help you with various problems. The concepts are introduced during joint computer exercises, interspersed with independent work. Emphasis is on learning to program and seeing what you can do with it. No prior knowledge is needed.
- Opettaja
Jon Brommer
Kategoria: Biologian laitos
BIOL4051 Biologinen aineisto: johdatus tilastomenetelmiin , Entinen "Biostatistiikan alkeet", sisältää luennot, verkkotehtävät ja mikroluokkaharjoitukset.
- Opettaja
Tero Klemola
Kategoria: Biologian laitos
Tavoitteet
Opiskelija tiedostaa alaansa liittyvät eettiset kysymykset ja kykenee perustelemaan niitä koskevat mielipiteensä.
Opiskelija tiedostaa alaansa liittyvät eettiset kysymykset ja kykenee perustelemaan niitä koskevat mielipiteensä.
- Opettaja
Päivi Koskinen
Kategoria: Biologian laitos
The aim is to familiarize students with various aspects related to
starting a career as a researcher, and conducting research in general;
the scientific method and various stages of employing science, including
drawing up a research plan, literature search and referencing, drawing
inferences from the empirical data, ethical considerations, the
presentation of scientific results, both written and orally, aimed at
the scientific community and the general public as well as composing a
CV and research career options within and outside of academia. During
the course, students gain an understanding of a researcher's work and
career.
- Opettaja
Jon Brommer
Kategoria: Biologian laitos
Biologiassa käytettäviin tilastotieteellisiin menetelmiin perehtyminen (suunnittelu, otanta, koeasetelmat, tilastolliset mallintamismenetelmät). Tilastollisten tulosten ymmärtämisen kehittäminen. Biologian ja tilastotieteen oikean suhteuttamisen oppiminen. Otanta- ja koesuunnitteluteoriaa erityisesti biologisia tutkimustilanteita painottaen. Lineaaristen mallien käyttö aineistoissa esiintyvien vaikutusten osoittamiseen.
- Opettaja
Tero Klemola
Kategoria: Biologian laitos
The student learns what is needed to complete the M.Sc. thesis in Evolutionary Biology, and plans the M.Sc. thesis. The course if for students in Master Degree Programme in Bioscience, Evolutionary Biology track
- Opettaja
Jon Brommer
Kategoria: Biologian laitos
- Opettaja
Irma Saloniemi
Kategoria: Biologian laitos
Tavoitteet
Kurssin käytyään opiskelija osaa laboratoriotyöskentelyn tärkeimpiä käytäntöjä turvallisuusnäkökohdat huomioiden ja osaa käyttää yleisimpiä laboratoriovälineitä omissa töissään. Opiskelija tutustuu DNA-analysoinnin perusteisiin.
Kurssin käytyään opiskelija osaa laboratoriotyöskentelyn tärkeimpiä käytäntöjä turvallisuusnäkökohdat huomioiden ja osaa käyttää yleisimpiä laboratoriovälineitä omissa töissään. Opiskelija tutustuu DNA-analysoinnin perusteisiin.
- Opettaja
Kai Ruohomäki
Kategoria: Biologian laitos
Tavoitteet
Kurssin käytyään opiskelija osaa laboratoriotyöskentelyn tärkeimpiä käytäntöjä turvallisuusnäkökohdat huomioiden ja osaa käyttää yleisimpiä laboratoriovälineitä omissa töissään. Opiskelija tutustuu DNA-analysoinnin perusteisiin.
- Opettaja
Riitta Nissinen
Kategoria: Biologian laitos
Lukion biologian kertauskurssi Turun normaalikoulussa syksyllä 2014
- Opettaja
Pirkko Heikinheimo
Kategoria: Turun normaalikoulu
Tavoitteet
Opintojakson suorittamisen jälkeen opiskelija pystyy toteuttamaan omaan alaansa liittyvän biologisen riskinarvioinnin. Opiskelija pystyy tunnistamaan biologisia riskejä erilaisissa ympäristöissä, arviomaan riskin todennäköisyyttä ja haitan vakavuutta ihmiselle tai ympäristölle sekä arvioimaan käytettävissä olevia keinoja haitan torjumiseksi. Opiskelija pystyy hyödyntämään tutkimustietoa sekä viranomaisilta saatavaa ohjeistusta riskinarvioinnin suorittamiseen ja riskinarviointidokumentaation laatimiseen.
Opintojakson suorittamisen jälkeen opiskelija pystyy toteuttamaan omaan alaansa liittyvän biologisen riskinarvioinnin. Opiskelija pystyy tunnistamaan biologisia riskejä erilaisissa ympäristöissä, arviomaan riskin todennäköisyyttä ja haitan vakavuutta ihmiselle tai ympäristölle sekä arvioimaan käytettävissä olevia keinoja haitan torjumiseksi. Opiskelija pystyy hyödyntämään tutkimustietoa sekä viranomaisilta saatavaa ohjeistusta riskinarvioinnin suorittamiseen ja riskinarviointidokumentaation laatimiseen.
- Opettaja
Riitta Nissinen
Kategoria: Kurssit Pepistä
Tavoitteet
Opiskelijan tulee
- osata: biomateriaalien luokittelu, peruskoostumukset ja käyttökohteet
- tietää: materiaaleihin kohdistuvat biologiset ja mekaaniset vaatimukset
- ymmärtää: materiaalien tarjoamat mahdollisuudet nykyaikaisessa rekonstruktiivisessa
ja regeneratiivisessa lääketieteessä ja hammaslääketieteessä.
Opiskelijan tulee
- osata: biomateriaalien luokittelu, peruskoostumukset ja käyttökohteet
- tietää: materiaaleihin kohdistuvat biologiset ja mekaaniset vaatimukset
- ymmärtää: materiaalien tarjoamat mahdollisuudet nykyaikaisessa rekonstruktiivisessa
ja regeneratiivisessa lääketieteessä ja hammaslääketieteessä.
- Opettaja
Pekka Vallittu
Kategoria: Biomateriaalitiede
Tavoitteet
Opiskelijan tulee
- osata: biomateriaalien luokittelu, peruskoostumukset ja käyttökohteet
- tietää: materiaaleihin kohdistuvat biologiset ja mekaaniset vaatimukset
- ymmärtää: materiaalien tarjoamat mahdollisuudet nykyaikaisessa rekonstruktiivisessa
ja regeneratiivisessa lääketieteessä ja hammaslääketieteessä.
Opiskelijan tulee
- osata: biomateriaalien luokittelu, peruskoostumukset ja käyttökohteet
- tietää: materiaaleihin kohdistuvat biologiset ja mekaaniset vaatimukset
- ymmärtää: materiaalien tarjoamat mahdollisuudet nykyaikaisessa rekonstruktiivisessa
ja regeneratiivisessa lääketieteessä ja hammaslääketieteessä.
- Opettaja
Pekka Vallittu, Niko Moritz
Kategoria: Biomateriaalitiede
- Opettaja
Pekka Vallittu
Kategoria: Biomateriaalitiede
Objectives
Subject specific competence
You will be able to differentiate the biomaterials in medicine and their central properties, explain the requirements set by the biomedical applications, outline biomaterial-tissue interactions and plan how to modify biocompatibility.
Transferable skills
Students will develop skills in assessing their learning. Students also develop their collaboration and communication skills as well as practice problem solving and creative thinking.
Subject specific competence
You will be able to differentiate the biomaterials in medicine and their central properties, explain the requirements set by the biomedical applications, outline biomaterial-tissue interactions and plan how to modify biocompatibility.
Transferable skills
Students will develop skills in assessing their learning. Students also develop their collaboration and communication skills as well as practice problem solving and creative thinking.
- Opettaja
Emilia Peltola
Kategoria: Kurssit Pepistä
Tavoitteet
Opintojakson suoritettuaan opiskelija on:
Opintojakson suoritettuaan opiskelija on:
- integroitunut Turun yliopistoon ja lääketieteelliseen tiedekuntaan
- oppinut arvioimaan omaa osaamistaan ja oppimistaan
- oppinut erilaisia stressinhallintakeinoja sekä laajempia ajanhallintataitoja
- oppinut tunnistamaan mielen hyvinvointia suojaavia ja uhkaavia tekijöitä sekä tietää, mistä voi tarvittaessa hakea ulkopuolista apua
- kehittänyt tieteellistä ajatteluaan ja asiantuntijuuttaan
- oppinut tunnistamaan ammatti-identiteettiinsä liittyviä tietojaan, taitojaan ja asenteitaan
- tunnistanut bioalan yrityksiä ja toimintaympäristöjä
- alkanut verkostoitumaan alan toimijoiden kanssa
- Opettaja
Visa Virtanen
Kategoria: MediOpe - koulutuksen kehittämisyksikkö
Pakollinen englanninkielinen kurssi lääketieteellisen tiedekunnan Terveyden biotieteiden ja Biokuvantamisen KV-maisteriohjelmissa opiskeleville. Vastuuopettaja Veikko Launis
- Opettaja
Veikko Launis
Kategoria: Lääketieteellinen etiikka
The students are introduced to planning and performing a research project in the field of biomedical imaging as well as to critical, scientific thinking. Students will learn to plan and report the planning strategies of their research project, execute the experimental part/data collection, and orally present their research work.
The Master's thesis project will be conducted under supervision in a research group. Before starting the practical part, a student must submit a thesis information form and a thesis plan and present the plan in Thesis plan seminar. Responsible professor of the programme need to approve the thesis plan before the practical part can begin. The subject of the project need to be first discussed with the responsible professor. The project duration is approximately five months of intensive work with the practical part of the project. The results of the thesis project will be presented in the Master's thesis seminar New Discoveries.
Students are responsible for finding their own thesis projects.
The credits are part of the master's thesis for students in biomedical imaging and are given for the thesis plan, the thesis plan seminar, the thesis seminar and the practical laboratory work/data generation for the thesis.
The written thesis consists of the relevant review of literature, aims of the study, materials and methods, results and conclusions. Thesis will be accepted by the responsible professor of the programme and evaluated by two examiners.
- Opettaja
Elena Tcarenkova
- Opettaja
Kari Vienola
Kategoria: Biolääketieteen laitos
Objectives
By choosing a project topic of their choice, the students will familiarize themselves with a research field related to the biomedical field, ranging from medical imaging used by the University Hospital to image analysis on human-derived image data done by various research groups within the university. The goal is to apply their knowledge and gain deeper understanding into the use of these techniques, whether it is medical imaging or ex vivo image analysis, and how they can improve future patient diagnostics. On the completion of the course, the student will be able to:
- Explain and understand in detail the techniques used in the project (whether it is image analysis or image acquisition).
- Identify key elements for a standard project workflow.
- Design/Execute a project in a company or university setting.
By choosing a project topic of their choice, the students will familiarize themselves with a research field related to the biomedical field, ranging from medical imaging used by the University Hospital to image analysis on human-derived image data done by various research groups within the university. The goal is to apply their knowledge and gain deeper understanding into the use of these techniques, whether it is medical imaging or ex vivo image analysis, and how they can improve future patient diagnostics. On the completion of the course, the student will be able to:
- Explain and understand in detail the techniques used in the project (whether it is image analysis or image acquisition).
- Identify key elements for a standard project workflow.
- Design/Execute a project in a company or university setting.
- Opettaja
Kari Vienola
Kategoria: Kurssit Pepistä
Tiiviskurssi Biometria ja tutkimus (TILM3614, opinto-oppaassa kurssi on nimellä Biostatistiikan ja lääketieteen erityiskysymyksiä) järjestetään 6.-8.5.2024 kolmen luentopäivän mittaisena.
- Opettaja
Kari Auranen
Kategoria: Matematiikan ja tilastotieteen laitos
Objectives
A student passing the course
- understands the various types of heterogeneity in proteins arising from both biological and non-biological factors.
- can estimate the level of purity and quantity of a protein necessary for a defined application.
- comprehends the fundamental principles underlying protein purification processes.
- knows the most essential techniques employed for protein purification, including their operational principles.
- comprehends the fundamental concepts and considerations related to the processes of concentrating, handling and storing of proteins.
- can formulate a tailored purification process for a specific protein.
- knows the functional principles of the most essential methods used for the characterization of proteins for their biochemical and –physical properties, such as their size, purity, interaction kinetics, isoelectric point, primary structure, stability, aggregation tendency.
- understands the roles and functionalities of essential expression systems utilized in recombinant protein production.
- grasps the composition and design principles of expression vectors used in recombinant protein production.
Working life skills:
- presentation skills
- teamwork
A student passing the course
- understands the various types of heterogeneity in proteins arising from both biological and non-biological factors.
- can estimate the level of purity and quantity of a protein necessary for a defined application.
- comprehends the fundamental principles underlying protein purification processes.
- knows the most essential techniques employed for protein purification, including their operational principles.
- comprehends the fundamental concepts and considerations related to the processes of concentrating, handling and storing of proteins.
- can formulate a tailored purification process for a specific protein.
- knows the functional principles of the most essential methods used for the characterization of proteins for their biochemical and –physical properties, such as their size, purity, interaction kinetics, isoelectric point, primary structure, stability, aggregation tendency.
- understands the roles and functionalities of essential expression systems utilized in recombinant protein production.
- grasps the composition and design principles of expression vectors used in recombinant protein production.
Working life skills:
- presentation skills
- teamwork
- Opettaja
Urpo Lamminmäki
Kategoria: Bioteknologian laitos
Tavoitteet
Opintojakson jälkeen opiskelija ymmärtää (1) lääkeaineiden kohdemolekyylien, proteiinien, rakenne-toiminta suhteen käsityksen; (2) reseptoreiden ja entsyymien toimintaan liittyvät erot ja samankaltaisuudet; (3) lääkeaineiden proteiiniin sitoutumisen periaatteet; (4) lääkeaineiden etsintää ja kehitystä johtolankamolekyyliksi ja edelleen lääkkeeksi; (5) lääkeaineiden aineenvaihduntaan liittyvien entsyymien toimintaa; (6) proteiini-proteiini vuorovaikutusten säätelyn lääkekehitykselle tarjoamia mahdollisuuksia.
Opintojakson jälkeen opiskelija ymmärtää (1) lääkeaineiden kohdemolekyylien, proteiinien, rakenne-toiminta suhteen käsityksen; (2) reseptoreiden ja entsyymien toimintaan liittyvät erot ja samankaltaisuudet; (3) lääkeaineiden proteiiniin sitoutumisen periaatteet; (4) lääkeaineiden etsintää ja kehitystä johtolankamolekyyliksi ja edelleen lääkkeeksi; (5) lääkeaineiden aineenvaihduntaan liittyvien entsyymien toimintaa; (6) proteiini-proteiini vuorovaikutusten säätelyn lääkekehitykselle tarjoamia mahdollisuuksia.
- Opettaja
Olli Pentikäinen
Kategoria: Perustutkinto-opinnot - keskeiset opinnot
Tavoitteet
Opintojakson jälkeen opiskelija ymmärtää (1) lääkeaineiden kohdemolekyylien, proteiinien, rakenne-toiminta suhteen käsityksen; (2) reseptoreiden ja entsyymien toimintaan liittyvät erot ja samankaltaisuudet; (3) lääkeaineiden proteiiniin sitoutumisen periaatteet; (4) lääkeaineiden etsintää ja kehitystä johtolankamolekyyliksi ja edelleen lääkkeeksi; (5) lääkeaineiden aineenvaihduntaan liittyvien entsyymien toimintaa; (6) proteiini-proteiini vuorovaikutusten säätelyn lääkekehitykselle tarjoamia mahdollisuuksia.
Opintojakson jälkeen opiskelija ymmärtää (1) lääkeaineiden kohdemolekyylien, proteiinien, rakenne-toiminta suhteen käsityksen; (2) reseptoreiden ja entsyymien toimintaan liittyvät erot ja samankaltaisuudet; (3) lääkeaineiden proteiiniin sitoutumisen periaatteet; (4) lääkeaineiden etsintää ja kehitystä johtolankamolekyyliksi ja edelleen lääkkeeksi; (5) lääkeaineiden aineenvaihduntaan liittyvien entsyymien toimintaa; (6) proteiini-proteiini vuorovaikutusten säätelyn lääkekehitykselle tarjoamia mahdollisuuksia.
- Opettaja
Olli Pentikäinen
Kategoria: Perustutkinto-opinnot - keskeiset opinnot
Tavoitteet
Kurssi antaa valmiudet tutkia proteiinien kolmiulotteisia rakenteita visualisointiohjelmien avulla sekä osoittaa rakenteista erilaisia vuorovaikutuksia. Kurssin jälkeen opiskelija tunnistaa mitkä tekijät proteiinin rakenteessa vaikuttavat lääkemolekyylien sitoutumiseen kohdeproteiiniin. Kurssin suoritettuaan opiskelija hallitsee proteiinien rakenteiden etsimisen tietokannoista, osaa tehdä proteiineista kuvia tieteellistä tarkoitusta varten, osaa hyödyntää oppimiaan taitojaan tieteellisen ongelman ratkaisemiseen sekä raportoida tuloksiaan tieteellisen tekstin muodossa.
Kurssi antaa valmiudet tutkia proteiinien kolmiulotteisia rakenteita visualisointiohjelmien avulla sekä osoittaa rakenteista erilaisia vuorovaikutuksia. Kurssin jälkeen opiskelija tunnistaa mitkä tekijät proteiinin rakenteessa vaikuttavat lääkemolekyylien sitoutumiseen kohdeproteiiniin. Kurssin suoritettuaan opiskelija hallitsee proteiinien rakenteiden etsimisen tietokannoista, osaa tehdä proteiineista kuvia tieteellistä tarkoitusta varten, osaa hyödyntää oppimiaan taitojaan tieteellisen ongelman ratkaisemiseen sekä raportoida tuloksiaan tieteellisen tekstin muodossa.
- Opettaja
Ulla Pentikäinen
Kategoria: Perustutkinto-opinnot - keskeiset opinnot
- Opettaja
Eliisa Löyttyniemi
Kategoria: Biostatistiikka
- Opettaja
Eliisa Löyttyniemi
Kategoria: Biostatistiikka